Музей Великого канала в Пекине расположен в северо-западной части городского зеленого центра Пекина, его общая площадь составляет около 99 700 квадратных метров. Он состоит из общего холла, выставочного здания (главного здания) и рекреационной водной улицы. Концепция дизайна музея основана на трех элементах древнего канала: лодках, парусах и воде. Канал служит связующим звеном, объединяющим историческую культуру и архитектуру. Форма крыши общего холла взята из «лодки», а форма крыши выставочного здания (главного здания) — из «паруса». Рекреационная водная улица между двумя зданиями в сочетании с элементами фасада выставочного здания (главного здания), такими как перекрестки улиц, навесы и ворота, образует сцену, похожую на причал канала.

В плане пространства и архитектурной формы северная сторона общего холла естественным образом соединяется с травянистым склоном, а южная сторона выставочного здания (главного здания) плавно переходит в городской парк «Зеленый сердце». Внутреннее и внешнее пространство гармонично сочетаются, позволяя посетителям наслаждаться природой во время посещения. Для обеспечения безопасности культурных ценностей под первым подземным этажом выставочного здания (главного здания) расположен сейсмоизолированный слой площадью 18 000 квадратных метров, который является самым большим по площади проекции среди сейсмоизолированных музеев, построенных в настоящее время в Китае. Общий холл, выставочное здание (главное здание) и прогулочная набережная относительно независимы, но связаны между собой, что делает их более открытыми и свободными, чем пространство отдельно стоящего музейного здания, и позволяет реализовать более гибкий режим работы музея, отвечающий требованиям современных музеев к разнообразию услуг.